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Über mich

Mein Erfahrungsbereich ist in der Molekularbiologie und Bioinformatik, insbesondere bei Genom-Analysen und IVD/PGS Anwendungen. Bisherige Jobs im akademischen als auch industriellen Bereich umfassten v.a. die Arbeit mit Next-Generation Sequenzier (NGS) Daten und genomischen screening Tests (z.B. arrayCGH).
Als Bioinformatik Freelancer, bzw. freiberuflicher Berater stehe ich nun im Grossraum Mannheim/Ludwigshafen/Heidelberg/Frankfurt und natürlich remote zur Verfügung. Ich kann gut im Team mit Laborwissenschaftler oder mit Softwareentwicklern arbeiten oder eigenständig für Sie Lösungen finden.

Projekte, an denen ich beruflich beteiligt war, umfassen z.B.:

  • Entwicklung und Anwendung einer weltweit führenden Genom-Annotations-Pipeline  (Ensembl, hauptsächlich Perl, etwas Java)
  • Infrastruktur-Entwicklung und Datenmanagement im Rahmen einer großen internationalen Kollaboration (ENCODE, hauptsächlich Perl)
  • Entwicklung von Genomischen Tests, insbesondere für for in-vitro Diagnostics (IVF, chromosomales screening, BlueGnome Ldt. & IlluminaPerl, MatLab, Python, C++)

Viele Projekte wurden mit Design-, Prototyping- und Testing-Phasen entwickelt, manche wurden zum ISO 13485 (medical devices) Standard konform ausgeführt. Das Verfassen von Dokumentation für Software und Bioinformatik-Projekte, sowie von peer-reviewed wissenschaftlichen Publikationen erledige ich gerne. Ich finde es sehr motivierend, Kunden meine Software zu erläutern und mit Ihnen Ideen zu entwickeln.

Weitere Stichworte zur Arbeit: Hochdurchsatz-Methoden, Pipeline-Entwicklung, Datenbank-Entwicklung, Webseiten-Design, Datenauswertung, Unix/HPC/Cloud-Systeme, bash scripting, in-vitro diagnostics (IVD).

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Über Sie

  • Sie sind eine kleine Firma ohne eigene Bioinformatik-Abteilung?
  • Oder Sie sind bereits grösser, haben aber trotzdem mehr Arbeit als Mitarbeiter?
  • Vielleicht wollen Sie einfach ein paar Ideen ausprobieren ohne gleich Vollzeitkräfte einzustellen?
  • Wollen Sie neue Strukturen in die Entwicklungs-Methoden einführen?
  • Vielleicht wollen Sie einfach von neuen Ideen von jemandem ausserhalb der Firma profitieren?
  • Sie etablieren gerade Hochdurchsatz-Sequenzier-Methoden und brauchen Unterstützung, die Datenmenge sinnvoll zu bewältigen??


Vielleicht können wir zusammen neue spannende Lösungen finden!

Hier ist der typische Ablauf eines Projektes beschrieben.

Kontakt

Gene-Test Bioinformatics Solutions
USt-ID DE315058947
Dr. Felix Kokocinski
Jakob-Müller-Str. 16
68623 Lampertheim

Tel: 06256 8595951

Kontaktieren Sie mich, wenn Sie meine Unterstützung als freier Mitarbeiter (Freelancer / Berater) bei Bioinformatik-Projekten benötigen!
Kontaktanfragen auf Deutsch oder Englisch.

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